جراحی انتهای ریشه که تحت عنوان عمل آپیکوکتومی (Apicoectomy) هم شناخته می‌شود، یکی از روش‌های درمان مشکلات انتهای ریشه دندان است. این جراحی در مواقعی ضروری است که درمان ریشه به تنهایی نتوانسته است مشکل ریشه را برطرف کند و همچنان عفونت در بخش انتهای ریشه باقی مانده است. با این جراحی می‌توان قسمت انتهای ریشه دندان را برداشته و ناحیه عفونت‌دار را پاکسازی کرد. گاهی هم علت جراحی انتهای ریشه، مشکلات ساختاری است مثل وجود انحنا یا پیچش‌هایی که دسترسی به آنها مشکل است و فقط با جراحی می‌توان به این قسمت دسترسی پیدا کرد.
